o estabelecimento da microbiota endodôntica depende de uma sucessão de eventos vinculados ao potencial de oxidorredução, disponibilidade de nutrientes e interações microbianas.

os nutrientes para a microbiota endodôntica podem ser derivados da cavidade oral, da desintegração dos tecidos pulpares, do conteúdo dos túbulos dentinários e de substâncias oriundas dos tecidos periapicais.

as interações microbianas podem ser consideradas de dois tipos: positivas e negativas. Ambos os tipos são responsáveis pela composição da população microbiana endodôntica.

microrganismos de alta prevalência em infecções endodônticas podem ser capazes de suprimir o crescimento e multiplicação de outros que competem pelo mesmo nicho ecológico.