A maioria dos casos de colite não requer terapia antimicrobiana e reponde a reidratação.

Uso empírico de ciprofloxacino 500-750mg VO, de 12/12 + Metronidazol 400mg VO, de 8/8.

Uso de Azitromicina 250-500mg de 6/6, quando os patógenos gastrointestinais são resistentes às fluorquinolonas.

Vancomicina 500mg IV, de 6/6h, na suspeita de C. difficile.

Hidrocortisona e Mesalazina, na colite ulcerativa.