Na coleta de sêmen em casa, o homem deve receber instruções claras, orais ou por escrito, sobre o processo de coleta e o transporte da amostra. As instruções devem enfatizar que a amostra de sêmen precisa ser incompleta, pois não é necessário coletar todo o conteúdo ejaculado. O transporte da amostra pode ser feito em até 3 horas após a coleta.

Na coleta de sêmen para fins de diagnóstico ou pesquisa, a amostra deve ser obtida por meio de masturbação e ejaculada em um recipiente limpo, de boca larga, feito de vidro ou plástico, de um lote que tenha sido confirmado como não tóxico para os espermatozoides. O recipiente para amostras deve ser mantido à temperatura ambiente, entre 20 °C e 37 °C.

Normalmente, executa-se o exame macroscópico após a liquefação do líquido seminal em banhomaria a 20ºC durante 2 horas. Nesse mesmo exame, observam-se também a motilidade e a vitalidade dos espermatozoides. Em seguida, realiza-se a coloração utilizando-se o corante Fast Green, executando o protocolo de preparação.

No exame microscópico, que deve ser executado 10 horas após a coleta em liquefação a 20ºC em banho-maria, são observados o volume, a cor, o cheiro, pH, viscosidade e consistência.

No método de coloração, uma vez que os esfregaços de sêmen tenham sido secos ao ar, eles devem ser fixados e corados para destacar os detalhes dos espermatozoides. A fixação tradicional e a coloração sequencial envolvem as seguintes etapas: etanol, água destilada, lugol, solução de Scott, EA 50 e violeta cristal, respectivamente.