Doença bacteriana com curso clínico bifásico (fases aguda e crônica), podendo se manifestar sob várias formas.

A fase crônica da doença é caracterizada por miocardite difusa, com vários graus de severidade, às vezes só identificada por eletrocardiograma ou ecocardiograma.

Na fase aguda, as manifestações clínicas mais comuns são febre de curta duração e recorrente, cefaleia, mialgias, astenia, edema de membros superiores ou membros inferiores, rash cutâneo, hipertrofia de linfonodos, hepatomegalia, esplenomegalia e ascite.

Em casos de transmissão vetorial, podem ocorrer sinais de porta de entrada: sinal de Romaña (edema bipalpebral unilateral) ou chagoma de inoculação (lesão a furúnculo que não supura).

A meningoencefalite é a principal complicação da doença e tende a ser letal, ocorrendo, geralmente, em casos de reativação (imunodeprimidos) ou em lactentes.