O gráfico acima representa um resultado de expressão gênica utilizando sondas gene-específicas.

A utilização do fluoróforo SYBR green (verde) é mais recomendada para detecção de mutação de ponto do que sondas alelo-específicas devido a sua maior especificidade.

Os produtos da reação são detectados na fase linear do processo de amplificação, permitindo uma quantificação mais precisa do que a do início da reação.

As sondas alelo-específicas do tipo Taqman® possuem um fluoróforo na extremidade 5' e uma molécula quencher na extremidade 3' e baseiam-se no método de transferência de energia de ressonância por fluorescência (FRET).

Para quantificar transcritos de RNA, é opcional realizar a síntese de cDNA utilizando a enzima transcriptase reversa.