Dentre as indicações, podem-se citar lesões inflamatórias que respondem ao tratamento local após a remoção do agente irritante.

Dentre as contraindicações da biópsia incisional, estão as lesões vasculares, como o hemangioma e as malformações vasculares, principalmente as que apresentam pulsação à palpação, pois há risco de sangramento abundante.

Os quatro tipos principais de biópsia são a biópsia incisional, a biópsia excisional, a citologia aspirativa e a biópsia esfoliativa.

A área da biópsia nunca deve se estender ao tecido adjacente clinicamente normal por aumentar a comorbidade do paciente, pelo aumento da ferida cirúrgica.

A biópsia excisional está indicada para lesões com suspeita de malignidade e para lesões que podem ser tratadas por outro meio, não cirúrgico, depois de estabelecido o correto diagnóstico.