Na miocardiopatia restritiva e na hipertrofia septal assimétrica com obstrução da via de saída, o TE está contraindicado.

Na miocardiopatia dilatada, as aplicações das provas de esforço são semelhantes às aplicações na insuficiência cardíaca.

Na forma não obstrutiva, protocolos convencionais poderão ser empregados, mas com cuidados especiais ao aparecimento de sinais de obstrução dinâmica.

Na miocardiopatia chagásica, o TE poderá ser realizado segundo protocolos convencionais, sendo que a presença de arritmias ventriculares em repouso contraindica o exame.