O Datasus foi criado em 1991, com a finalidade de coordenar o desenvolvimento dos Sistemas de Informação em Saúde (SIS), para atender às necessidades do SUS.

Ao Ministério da Saúde compete, por meio do Datasus, a guarda, a preservação e o acesso seguros das bases de dados dos Sistemas de Informação em Saúde (SIS), fontes para a elaboração de relatórios estatísticos que auxiliam a indicação do perfil de situação de saúde de estados, de municípios e do país.

O marco da institucionalização dos Sistemas de Informação em Saúde (SIS) no Brasil foi a padronização do formulário de declaração de nascidos vivos e do fluxo da coleta de dados correspondentes, na década de 1970.

O Instituto Brasileiro de Geografia e Estatística (IBGE) auxilia o Ministério da Saúde em levantamentos e pesquisas que geram dados e informações para o Sistema Único de Saúde (SUS), em que se destacam os Censos Demográficos, as Estimativas e Projeções Populacionais e a Pesquisa Nacional de Saúde.

Os Sistemas de Informação em Saúde (SIS) do SUS agregam diversos tipos de bases de dados (sistemas e subsistemas) com funções e objetos de registro de diferentes naturezas, como o Sistema de Informações Hospitalares do SUS (SIH-SUS); e o Sistema de Acompanhamento da Gestante (Sisprenatal), entre outros.