O uso de equipamento de proteção individual tem a finalidade de impedir que microrganismos provenientes de pacientes, por meio de sangue, fluidos orgânicos, secreções e excreções, contaminem o profissional de saúde.

Utiliza-se a desinfecção quando se objetiva destruir todos os microrganismos presentes em determinado material ou superfície.

A esterilização pode ser realizada em autoclave, que utiliza calor seco, ou em estufa que utilizada calor úmido, sendo mais indicado o uso de estufa para esse fim.

Hepatite B, hepatite C, leishmaniose, herpes, AIDS e tuberculose podem ser adquiridas por contaminação na prática odontológica.

Conforme o risco de transmissão de infecção e a necessidade de esterilização ou desinfecção, os instrumentos cirúrgicos, são classificados em duas categorias: críticos ou semicríticos.