A polipectomia é mais bem realizada quando o pólipo visível no colonoscópio está entre 5h e 7h.

Lesões de até 5 mm são facilmente removíveis por pinça de biópsia a frio. Lesões entre 5-8 mm podem ser removidas com alça a frio, já lesões maiores que 8 mm e pediculadas devem ser preferencialmente removidas com alça com uso de eletrocautério.

A ressecção endoscópica da mucosa é indicada para pólipos grandes, aqueles que envolvem mais de um terço da circunferência do cólon ou duas dobras haustrais ou com morfologia plana ou deprimida. Muitas vezes resulta em excisão fragmentada do pólipo, podendo causar dificuldades para diagnóstico histológico e avaliação de margens.

A grande limitação da ressecção endoscópica de mucosa é determinar quais lesões estão realmente confinadas somente à mucosa. Os principais fatores de risco para invasão submucosa são: morfologia de superfície não glandular, classificação 0-IIa+b de Paris e padrão de depressão de Kudo tipo III.