Com relação à ventilação mecânica e monitorização deve-se trabalhar com um tempo expiratório prolongado, ajustado em, no mínimo, 0,5 s aproximadamente.

Devido ao quadro inflamatório há aumento na quantidade de secreção brônquica, porém o fisioterapeuta não deverá utilizar a técnica de Expiração Lenta e Prolongada (ELPr).

A presença de SAM pode desencadear uma lesão no pulmão em desenvolvimento (quanto à hiper-reatividade brônquica); na fase aguda, as manobras de higiene brônquica devem ser realizadas de forma regular.

A fisioterapia deve ser iniciada quando o paciente apresentar: secreção visível em vias aéreas ou cânula orotraqueal; ausculta pulmonar com presença de roncos e estertores; atelectasia à radiografia simples de tórax; e, sinais clínicos que evidenciam aumento da dispneia.

A Hipertensão Pulmonar Persistente do Recém-nascido (HPPRN) é, muitas vezes, secundária à SAM. O óxido nítrico é utilizado como tratamento e deve ser monitorado. O fisioterapeuta deverá acompanhar o início e gradual desmame, observando o critério de evitar doses maiores que 20 ppm.