O tratamento primário é feito através de filtração biológica, processo de lodos ativados, decantação intermediária e lagoas de estabilização.

O tratamento secundário inclui as chamadas lagoas de maturação, cloração para desinfecção, ozonização para desinfecção, remoção de nutrientes, remoção de complexos orgânicos, eletrodiálise, osmose reversa, troca iônica, remoção de nutrientes.

O tratamento terciário consiste na decantação, flotação, geralmente bolhas de ar ou compostos químicos, digestão e secagem do lodo e sistemas compactos (decantação e digestão).

Para a remoção do odor e controle de doenças pode ser feita cloração, utilização de reagentes químicos e instalações biológicas.