Os materiais sujos de matéria orgânica devem ficar imersos em detergentes enzimáticos por cerca de 3 a 5 minutos, tempo necessário para desagregar a matéria orgânica. Devem ser colocados abertos e desconectados em recipiente não metálico, tendo-se o cuidado de evitar que materiais diferentes sejam postos no mesmo recipiente.