Proteínas, polissacarídeos e ribossomos são separados das partículas virais durante o processo denominado de clarificação.

Na ultracentrifugação em almofada de sacarose a 40% os componentes celulares sedimentam e os vírus ficam na suspensão que é recolhida.

A centrifugação diferencial irá separar as partículas virais de componentes celulares que possuam tanto coeficiente de sedimentação maior como menor que o do vírus.

Na concentração viral, o solvente orgânico forte como o clorofórmio pode ser substituído pelo N-butanol ou tetracloreto de carbono, conforme seja a estabilidade da partícula viral.

O EDTA dispersa as partículas virais; o butanol emulsifica o extrato deixando as partículas virais na fase orgânica (lipossolúvel); o β-mercaptoetanol inibe a atividade de enzimas oxidativas.