As substâncias químicas que ajudam a evitar infecções ou inibem o crescimento microbiano são as secreções, como a saliva, a transpiração e as secreções vaginais e gastrointestinais.

Pele e mucosas íntegras, algumas substâncias químicas, estruturas especializadas, como os cílios e a flora normal, podem favorecer o estabelecimento dos agentes patogênicos no corpo.

Se o micro-organismo conseguir passar pela segunda linha de defesa, por exemplo, entrando no corpo por uma laceração da pele, os glóbulos brancos e a resposta inflamatória entram em ação.

A inflamação produz três sinais e sintomas fundamentais: rubor, edema e calor devido à vasoconstrição local, ao vazamento de líquidos para os espaços intracelulares e o bloqueio da drenagem linfática.