A Farmácia Hospitalar deve estar localizada em área que permita fácil acesso para circulação e reabastecimento, facilitando a distribuição dos medicamentos e garantindo seu armazenamento dentro dos critérios técnicos.

O dimensionamento de uma Farmácia Hospitalar no Brasil é estabelecido por lei como de 1,5m² por leito hospitalar.

A Farmácia Hospitalar deve ser dirigida por um Farmacêutico ou Médico com especialização em Farmacologia.

A Farmácia Hospitalar deve ocupar uma posição adequada na estrutura organizacional da unidade hospitalar, sendo recomendada a sua vinculação a área de gerência de materiais dada a sua natureza estritamente logística-administrativa.