O TEPT é de difícil diagnóstico diferencial de quadros de Pânico e de Ansiedade Generalizada, pois o sintoma central de ambos é ansiedade intensa associada a reatividade neurovegetativa.

A maioria dos pacientes portadores de TEPT entram em remissão no curso natural da doença, o que pode confundir a avaliação da resposta a intervenções psicossociais.

O evento produtor de TEPT é, na maior parte dos casos, relacionado com temores específicos do indivíduo portador, sendo pouco relacionado portanto com a intensidade do estímulo.

As revivências (ou flashbacks) são comuns no TEPT, mas costumam remitir logo no início da instalação do quadro clínico, dando lugar a outros sintomas mais persistentes, como a intensa reatividade neurovegetativa diante de estímulos pareados ao estresse original.