A auditoria operacional enfoca a eficiência e eficácia dos processos organizacionais, enquanto a auditoria financeira se concentra na verificação da fidedignidade das demonstrações contábeis.

Ambas as auditorias avaliam aspectos financeiros das organizações, mas a auditoria operacional também abrange a análise de controles internos e gestão de riscos.

A auditoria financeira tem como objetivo principal verificar a legalidade dos atos de gestão e a correta aplicação dos recursos públicos, enquanto a auditoria operacional investiga a conformidade com normas e procedimentos.

Auditoria operacional e auditoria financeira são termos que se referem ao mesmo tipo de avaliação da gestão pública, variando apenas na nomenclatura utilizada.

A auditoria operacional se destina a avaliar a adequação, eficiência e eficácia dos controles internos das organizações, enquanto a auditoria financeira verifica a conformidade com normas e princípios contábeis.