Na eletroforese de zona, as macromoléculas são separadas quase que exclusivamente com base na sua carga de superfície: quanto maior for a carga, menor será a velocidade de migração.

A imunoeletroforese é um método quantitativo, aplicável a qualquer substância solúvel que seja imunogênica e cujos anticorpos não se precipitam.

Em gel de agarose, ocorre um fenômeno chamado eletroendosmose, em que há um movimento claro da água para o pólo positivo para compensar as cargas do gel que são atraídas para o polo negativo.

A imunoeletroforese combina dois métodos: a eletroforese em gel, seguida de imunodifusão e precipitação das proteínas.

Quando a mobilidade eletroforética é maior que a velocidade da eletroforese, o movimento resultante é a migração para o polo negativo.