A microtomia consiste em executar cortes bem finos, com espessura ideal que pode variar de 3 a 5 micrômetros.

A navalha é uma das peças fundamentais do micrótomo, sendo as de aço as mais utilizadas devido ao seu baixo custo.

Para a realização da microtomia, o bloco de parafina precisa estar em temperatura ambiente e fixo no micrótomo.

O objetivo da impregnação é envolver o exterior do material biológico com a parafina líquida, formando blocos.

Na etapa de inclusão, o material é colocado em um molde que será preenchido com a parafina líquida, sendo a posição da peça irrelevante.