O tamanho em pares de bases de um fragmento de DNA pode ser calculado a partir da migração em um gel de agarose 1% submetido à eletroforese. Para o cálculo, é necessário colocar um padrão com fragmentos de DNA conhecidos, como o fago lambda digerido com a enzima de restrição HindIII. O tamanho de um determinado fragmento pode ser calculado porque:
