Ratos e camundongos são homeotérmicos, ou seja, controlam a temperatura corporal independentemente da variação térmica do ambiente. Deste modo, a temperatura da sala não necessita ser uma variável controlada.

A temperatura e umidade da sala de alojamento devem ser rigorosamente controladas de modo a assegurar uma temperatura entre 18 e 20 ºC no interior da unidade de alojamento primário.

A temperatura da sala de alojamento deve ser mantida entre 20 e 24 ºC, enquanto a umidade deve estar entre 35 e 45%, de modo a evitar a rápida deterioração do material utilizado como forração para os animais.

A sala de alojamento deve permitir a entrada de luz natural, de modo que os animais estejam sujeitos a fotoperíodo natural e possam manter a sazonalidade dos seus ritmos biológicos.