A evacuação eficiente das excretas dificulta as condições higiênicas das instalações, favorecendo a difusão de vários microrganismos patogênicos.

O gás de amônia derivado da degradação da ureia, presente nos dejetos tem cheiro que incomoda e começa a irritar as mucosas, originando problemas respiratórios e oculares nos animais.

A construção de esterqueiras para esterco sólido é praticamente ao nível do solo, localizada aproximadamente ente 29 a 49 metros das instalações dos animais para não comprometer a sanidade do rebanho.

O esterco é elemento aproveitável para a agricultura mas deve receber tratamento prévio adequado, para evitar que determinados microrganismos se mantenham vivos no esterco constituindo fontes de infecção. Entretanto os ovos de Helmintos e suas formas parasitárias dificilmente são eliminados dos dejetos.

Quando a esterqueira estiver cheia, deve-se aplicar uma fina camada de cal virgem por cima e para fechar basta cobri-la com lona plástica. O tempo de exposição necessário para que ocorra a fermentação varia de 15 a 20 dias.