As divisões que ocorrem durante a segmentação denominam-se clivagens, e as células que se formam são chamadas pronúcleos.

Ao longo do desenvolvimento embrionário, as células passam por um processo de diferenciação celular em que alguns genes são "ativados". Surgem dessa maneira os tipos celulares, que se organizam em tecidos.

Na gastrulação, forma-se o blastóporo. Os animais em que o blastóporo dá origem ao ânus são chamados de protostômios, e os animais em que o blastóporo dá origem à boca são chamados de deuterostômios.

A placenta é considerada um anexo embrionário, por ser um órgão formado por tecidos de origem materna.