O exame físico deve buscar identificar sinais de porta de entrada próprios da transmissão vetorial, como o sinal de Romaña, que é um edema bipalpebral unilateral por reação inflamatória à penetração do parasito na conjuntiva e adjacências.

Uma das formas de transmissão investigada ocorre por via oral. Nesses casos, deve ser observado se há sangramentos digestivos como hematêmese, hematoquezia ou melena.

Deve-se verificar se o paciente é imunodeprimido, portador de leucemia, usuário de drogas imunodepressoras ou coinfectado pelo vírus da imunodeficiência humana adquirida, pois este relata maior tolerância à doença de Chagas.

Durante o exame, deve-se estar atento às indicações da fase aguda da doença, na qual o paciente pode apresentar sintomas leves como febre, mal-estar, edema em um dos olhos e fadiga.