O tabagismo parece conferir um efeito protetor contra o desenvolvimento da doença de Crohn, bem como uma influência terapêutica, podendo a nicotina induzir a remissão em alguns casos; a colite ulcerativa é mais comum em tabagistas e parece ser agravada pelo vício.

A colite ulcerativa e a doença de Crohn são mais comuns entre mulheres que não usam contraceptivos orais, em comparação com aquelas que usam.

Os pacientes que tiveram uma apendicectomia parecem ter um menor risco de desenvolvimento de colite ulcerativa.

Tem-se enfatizado que o processo inflamatório na doença de Crohn poupa as camadas musculares do colon, uma característica que a diferencia da colite ulcerativa (a última se caracteriza por inflamação transmural, ou envolvimento de todas as camadas da parede intestinal).

A presença de anticorpos citoplasmáticos antineutrófilos perinucleares com um padrão de coloração perinuclear (pANCA) tem sido usada como teste diagnóstico para ajudar a confirmar o diagnóstico da doença de Crohn, em que são vistos em até 86% dos pacientes.