A estrutura funcional talvez seja a forma mais lógica e básica de departamentalização, sendo usada principalmente, mas não somente, por empresas menores que oferecem uma linha de produtos limitada, porque torna mais eficiente o uso de recursos especializados.

Numa estrutura matricial, os empregados têm na verdade dois chefes, isto é, estão sob a autoridade dual, o que facilita a locação eficiente de especialistas.

À medida que uma organização cresce, seja geograficamente ou em produção, a estrutura funcional começa a apresentar desvantagens, pois torna-se difícil obter decisões ou agir rapidamente sobre um problema.