O eixo estrutura tem como finalidade produzir documentos técnicos e disponibilizar informações que possibilitem o acompanhamento, monitoramento e avaliação das ações e serviços da Assistência Farmacêutica.

A operacionalização dos eixos do QUALIFAR-SUS é regulada em atos específicos, mediante pactuação prévia no âmbito da Comissão Intergestores Regional (CIR) de cada estado da Federação.

A contribuição para garantia e ampliação do acesso da população a medicamentos eficazes, seguros, de qualidade e o seu uso racional, visando à integralidade do cuidado, resolutividade e o monitoramento dos resultados terapêuticos desejados é uma das diretrizes do QUALIFAR-SUS.

No eixo informação, há a inserção da Assistência Farmacêutica nas práticas clínicas visando à resolutividade das ações em saúde, otimizando os benefícios e minimizando os riscos relacionados à farmacoterapia.