Uma amostra limpa, de manhã cedo em jejum é em geral a menos concentrada e, portanto, é a preferida para um exame microscópico.

A amostra de segunda micção é a urina excretada durante um período após um esvaziamento completo da bexiga não sendo por isso recomendada para realização de análises.

Amostras obtidas por sonda são usadas para fazer exames microbiológicos em pacientes criticamente doentes, ou naqueles com obstrução das vias urinárias, mas não devem normalmente ser obtidas apenas para exame de constituintes químicos.

Embora os testes de laboratório de química clínica não sejam em geral afetados pela falta de procedimentos de coleta estéril, a genitália do paciente não necessita ser limpa antes de cada micção.