Os animais devem ser obtidos pelo menos 1 e preferencialmente 2 dias antes do uso pretendido, para que seja permitido um período apropriado para aclimatação ao novo ambiente.

Durante esse período, há a exacerbação das alterações metabólicas e hormonais causadas pelo estresse do transporte, e o animal deverá ser monitorado e receber tratamento para quaisquer sinais de problemas de saúde.

Para procedimentos sem recuperação ou não invasivos, como avaliações da ingestão de alimentos e água ou realização de testes comportamentais, é possível dispensar o período de aclimatação em roedores.

Se os animais forem alojados individualmente após um procedimento cirúrgico, é preferível aclimatá-los previamente a esse ambiente. Isso permitirá a adaptação ao estresse do isolamento social previamente ao estresse da anestesia e da cirurgia.

A aclimatação não é necessária em espécies de maior porte, como suínos e ovinos.