Um indicador deve garantir consistência interna (valores coerentes), sendo um instrumento para a avaliação do desempenho individual de profissionais de saúde; sua principal limitação é a custo-efetividade, já que o investimento de tempo e recursos para a coleta de dados raramente se justifica pelos resultados obtidos.

Um indicador deve possuir validade (medir o que se propõe a medir), sendo crucial para a estratificação de risco epidemiológico em diferentes grupos e territórios; contudo, sua comparabilidade pode ser comprometida pela falta de padronização nos procedimentos de medição e cálculo entre diferentes fontes ou períodos.

Um indicador deve priorizar a complexidade em seu método de cálculo para garantir precisão, sendo usado para o planejamento de compras de insumos; sua principal limitação é a subnotificação, que afeta exclusivamente indicadores de mortalidade, como a Taxa de Mortalidade Infantil.

Um indicador deve ter relevância (responder a prioridades de saúde), sendo utilizado para definir o orçamento federal; sua maior limitação é a integridade (dados completos), pois sistemas como o SINAN e o SIM sempre apresentam dados completos, tornando a análise excessivamente simplista.