Durante a primeira metade do século XIX, por ordem de D. João VI, foram criadas três grandes instituições museais de destaque em território brasileiro: o Museu Emílio Goeldi, o Museu Naval e o Museu Paranaense.

A respeito do papel dos índios e negros na sociedade do período, esta era uma questão de relevância central nas discussões dos primeiros museus de História Natural do país, tema este debatido largamente por naturalistas brasileiros e estrangeiros nessas instituições.

Quando a família real portuguesa chegou ao Brasil, já existiam em nosso território algumas instituições de caráter museológico, como por exemplo o Museu Paranaense e o Museu Paulista, ambos dedicados à guarda das memórias e histórias locais.

Durante a primeira metade do século XIX, o Museu Real foi, de modo mais ou menos precário, o único expressivo centro de experiência museal no Brasil.

A fixação da corte portuguesa no Brasil trouxe grandes benefícios às instituições museais existentes no território da colônia, pois a família real era responsável pelo maior número de doações de acervos aos museus históricos existentes naquele período.