A alta temperatura e o excesso de chuvas possibilitaram a proliferação e distribuição de cianobactérias.

O despejo de esgotos e resíduos da produção primária, proveniente dos rios da região e da própria capital, favorece a proliferação de coliformes termotolerantes.

Nessa época, a diminuição das chuvas e a maior incidência de sol, com elevação da temperatura, propiciam a proliferação de Cianobacterias que liberam a substância não tóxica Geosmina, alterando também o sabor da água.

Há proliferação de cianobactérias tóxicas, porém não existe obrigatoriedade legal para detecção das cianobactérias e cianotoxinas na água para abastecimento público.

A eutrofização natural, que é um processo dinâmico causado pela deposição de fertilizantes químicos na agricultura, favoreceu a proliferação de algas e bactérias resistentes.