a rigidez de suas linhas de comando verticalizadas.

a visão parcial dos projetos em função das limitações do coordenador do projeto.

a separação entre estrutura vertical (ou funcional) e a estrutura horizontal (projetos).

menor versatilidade e dificuldade de otimizar o uso dos recursos humanos.

o potencial de conflito entre a chefia funcional e a coordenação do projeto.