Esofagostomia cervical e gastrostomia devem ser as condutas iniciais nas atresias sem fístula, porque a distância entre os cotos não é muito grande.

Os principais fatores prognósticos são a presença de malformações associadas graves (cardíacas e genéticas) e pneumonia aspirativa.

Quando associada à fístula traqueoesofágica distal em pacientes sem malformação grave e com peso de nascimento de 3100 g, a expectativa de vida está ao redor de 95%.

Entende-se por “fístula em H” a presença de atresia de esôfago com fístula entre o coto proximal do esôfago e a traquéia.