Os répteis são organismos termodependentes, sofrendo influência da temperatura do ambiente sobre os processos de digestão, absorção e metabolismo dos nutrientes, de modo que, para que seu metabolismo funcione adequadamente, recomenda-se que, ao serem mantidos em regiões com temperaturas frias, aumente-se a frequência ou a quantidade de alimento fornecido.

Nos répteis, a prevenção do desenvolvimento de doenças osteometabólicas depende da presença de vitamina D no organismo, que é obtida por um processo metabólico no qual a pró-vitamina D3 é produzida pelas células da pele, que, ao ser exposta a radiação UVA, é rapidamente convertida em pré-vitamina D3.

Répteis carnívoros aquáticos, quando alimentados com peixes congelados, são suscetíveis a deficiência de biotina (vitamina B7), uma vez que, no processo de congelamento, a enzima tiaminase inativa a biotina presente no peixe. Para evitar o desenvolvimento de hipovitaminose B7, deve-se ter o cuidado de fornecer preferencialmente peixes frescos, ou então suplementar a dieta com biotina.

Deficiência proteica é a doença nutricional mais comum em serpentes mantidas em cativeiro. Caso o animal não volte a se alimentar, deve-se proceder a alimentação forçada, na quantidade de 25-50% do peso do animal.

O hiperparatireoidismo secundário é uma doença nutricional que pode acometer com maior frequência indivíduos juvenis de tartarugas, cágados e jabutis. Essa condição se origina do consumo de dietas pobres em cálcio, vitamina D3 ou ocasionalmente em dietas com relação cálcio/fósforo invertida. Em indivíduos carnívoros, a deficiência está geralmente associada ao fornecimento de dietas de carnes sem ossos, presas neonatais ou insetos não suplementados.