Documentos contendo respostas do auditado não deverão ser inseridos no Processo de Auditoria, devendo conter, no Relatório Final, apontamentos que contestem as alegações do auditado julgadas convenientes.

Na redação do relatório, a equipe de auditoria deve orientar-se pelos requisitos resumidos no mnemônico 4CTI: Clareza, Concisão, Convicção, Confiabilidade, Tecnicidade e Intempestividade.

O Relatório Final deve contextualizar a auditoria, abordando origem, antecedentes, objetivos, escopo e visão geral do objeto, bem como os métodos adotados na execução dos trabalhos na fase analítica e na fase operativa, informando, por exemplo, os tipos de documentos analisados, os sistemas de informações verificados, as origens/fontes dos recursos financeiros analisados (se possível, o percentual), as instituições visitadas na atividade, a realização de eventuais visitas domiciliares, a utilização e o tipo de instrumentos para coleta de dados, e, se for o caso, circularização, entrevistas com usuários, com trabalhadores de Saúde e com gestores.

Caso não ocorra a apresentação de justificativa, a equipe sobrestará o processo, haja vista que a revelia implicaria no reconhecimento da verdade dos fatos e na renúncia ao direito do auditado (art. 27 da Lei n.° 9.784/1999).

O Relatório Final, sempre que possível, deverá conter recomendações a serem implementadas pelos gestores competentes, não para promover o saneamento das irregularidades encontradas, mas para melhorar os processos de auditoria, controle e fiscalização futura.