As classificações morfológicas da gênese dos lagos baseiam-se, em geral, na divisão em bacias de lagos feitas por processos:
(1) Tectônicos
(2) Erosivos
(3) Vulcânicos
(4) Glacial
(5) Deposicionais
Neste sentido, os lagos pantanosos amazônicos podem ser enquadrados nas categorias correspondentes aos itens acima:
