O método baseia-se na ligação de um resíduo de aminoácido através de seu grupo carboxila a uma base polimérica funcionalizada e insolúvel (resina). A funcionalização pode ser um grupo amina. Assim, após a reação do primeiro resíduo de aminoácido, forma-se uma ligação amídica com a resina. O grupo Fmoc serve como estabilizador dos aminoácidos, evitando a racemização do mesmo. Ele deve ser removido pela presença de uma base orgânica antes da reação. A cadeia polipeptídica vai crescendo após cada ciclo de reação e desproteção do carboxi- para o amino-terminal. Por fim, remove-se o peptídeo sintetizado da resina.