Desde o período neonatal, o quadro clínico clássico (hipotonia, icterícia prolongada, sonolência, choro rouco e dificuldade para mamar) está presente.

A realização da triagem neonatal para HC é obrigatória, no Brasil, para todos os recém-nascidos.

O recém-nascido com triagem neonatal alterada deve ser encaminhado imediatamente para um centro de referência.

Se TSH > 40 mU/L, na triagem neonatal, o tratamento deve ser iniciado assim que os exames forem coletados sem aguardar pelos resultados.

Em crianças maiores, se o diagnóstico não foi realizado anteriormente, podem ocorrer fácies característica (cretinismo) e baixa estatura.