Auditoria de Conformidade: examina a legalidade dos atos de gestão responsáveis sujeitos à jurisdição.

Auditoria de Natureza Especial: objetiva apurar denúncias ou atender demandas específicas não planejadas.

Auditoria de Operacionalização Direta: envolve a participação de técnicos de um mesmo componente do SNA.

Auditoria Operacional: é realizada com a participação de técnicos do SNA e de outros órgãos de controle interno e externo.