A utilização de agentes mutagênicos no melhoramento genético de plantas é bastante limitada, uma vez que é impossível a produção de mutantes em espécies autógamas.

O processo de hibridação artificial é uma das etapas mais importantes no melhoramento genético de uma espécie vegetal e, geralmente, a emasculação da flor que será polinizada é feita de maneira automatizada.

Para transferência dos genes de interesse para as plantas podem ser utilizadas bactérias do solo do gênero Agrobacterium, que, ao infectarem plantas dicotiledôneas, são capazes de inserir seus próprios genes no genoma da planta.

Atualmente, não existe nenhuma técnica disponível para a transferência direta de genes para células vegetais.

O sistema de transformação via Agrobacterium pode ser utilizado para qualquer espécie vegetal sem restrições conhecidas.