Os sistemas operacionais Linux podem ser inicializados tanto no modo automático como no modo manual. No modo automático, o sistema executa o procedimento de inicialização completo por sua conta, sem qualquer comando externo. No modo manual, o sistema segue o procedimento automático até determinado ponto, a partir do qual, antes de a maioria dos scripts de inicialização ter sido executada, passa o controle ao operador da máquina.