São características microscópicas da hepatite crônica o infiltrado mononuclear portal, necrose de hepatócitos, hepatite de interface, fibrose e reação ductular, dilatação e congestão de sinusoides, predominantemente na área centrolobular, com atrofia importante dos hepatócitos, que em casos graves podem desaparecer.

A hepatite autoimune compartilha padrões de lesão com as hepatites virais. O tempo de progressão histológica é semelhante, havendo uma fase precoce de destruição grave do parênquima, seguida anos após pela formação de cicatrizes fibróticas.

A hepatite viral aguda caracteriza-se pela presença do infiltrado inflamatório e pelo aspecto heterogêneo das células parenquimatosas, provocado pela necrose focal, apoptose e balonização (tumefação) dos hepatócitos, causando uma perda na organização regular das trabéculas, uma característica diagnóstica útil.

São características de esteato-hepatite alcoólica a tumefação (balonização) de hepatócitos, necrose confluente, multinucleação de hepatócitos, corpúsculos de Mallory-Denk, infiltrado leucocitário predominantemente linfocítico e fibrose portal.