Para tuberculose miliar, a punção/biópsia de medula óssea tem acurácia diagnóstica superior à biópsia transbrônquica.

Na tuberculose pleural, a sensibilidade diagnóstica da biópsia de pleura por pleuroscopia não ultrapassa os 40%.

Na suspeita de espondilite por tuberculose, a punção/biópsia guiada por imagem somente deve ser realizada em casos selecionados pelo risco do procedimento.

Um teste rápido molecular para tuberculose do líquido pleural negativo exclui a necessidade de biópsia pleural nos casos suspeitos de derrame pleural tuberculoso.

A baciloscopia do tecido é, frequentemente, negativa nos pacientes não imunossuprimidos, mas, frequentemente, positiva nos pacientes com imunossupressão mais avançada, em que a identificação de granuloma é incomum.