a segunda metade do século XVIII foi significativa para Santos, pois foi quando foi criada a Alfândega de Santos em 1550, sendo o mesmo ano da chegada dos padres jesuítas para a catequização dos índios tupis que ali moravam.

o arsenal de defesa instalou-se em 1552, e a ordem dos carmelitas em 1589, sendo um período em que Santos sofreu com invasões e saques dos corsários, por ser um porto relativamente próspero.

no século XVII, seguindo uma tendência de toda a Capitania de São Vicente, a vila de Santos entrou em um longo e lento processo de estagnação e posterior decadência, sendo quando muitos habitantes da vila, na tentativa de buscar uma atividade econômica, se juntaram aos habitantes da vila de São Paulo de Piratininga e partiram nas expedições conhecidas como bandeiras.

no fim do século XVIII, a vila retoma o desenvolvimento e sua população começa a crescer, com a construção da Calçada do Lorena - estrada de ligação de Santos com São Paulo, o desenvolvimento na infraestrutura (iluminação pública, melhoramentos no porto) e a posterior abertura dos portos brasileiros com a vinda da família real portuguesa reativaram o dinamismo econômico da vila.