O principal critério para a seleção do método de conservação é o tipo de semente da espécie que se quer conservar, com relação ao seu comportamento quando submetida a condições de baixa umidade e baixa temperatura, isto é, se a semente é ortodoxa ou recalcitrante.

Para uma espécie de semente ortodoxa, a conservação ocorre pela manutenção de sementes sistema in vitro, em condições de umidade controladas.

O monitoramento das coleções mantidas a baixas temperaturas é fundamental e permite que o monitoramento seja mais flexível e seja realizado irregularmente.

No caso de espécies recalcitrantes ou de espécies das quais se pretendem manter determinados genótipos, a principal estratégia de conservação é pela manutenção de sementes em câmaras frias a - 20° C.

Cultivo in vitro consiste na manutenção de plantas em meio de cultura, sob condições estéreis, em frascos de vidro. Deve ser utilizada no caso de espécies de sementes ortodoxas.