No Pantanal Mato-Grossense pode ser visto algumas espécies de animais ameaçados de extinção, como a arara-azul, muito visada por traficantes e que sofrem com o desmatamento.

A onça-pintada, o maior felino das Américas, vem sendo abatido pelos pecuaristas, porque elas costumam atacar os rebanhos, mas existe projetos em andamento, que tentam protegê-la.

Alguns produtores da região do Pantanal preservam intactas grande parte de sua propriedade, mas temem que essas terras venha a ser desapropriada, independentes de sua vontade.

Os fazendeiros do Pantanal ficam indecisos entre medidas que tentam limitar os desmatamentos e outras que os pressionam por um maior aproveitamento econômico dessa área.

O número de determinadas espécies, tal como os répteis e os anfíbios, caem pela metade nos locais em que são substituídos o capim original por outro tipo de vegetação.