A coleta de escarro deve ser realizada pela manhã, logo ao acordar (antes do café da manhã).

É importante realizar a higiene oral prévia e deve-se orientar o paciente a coletar secreção da nasofaringe.

A coleta do material deve ser realizada em potes plásticos, descartáveis, transparentes, com boca larga e tampa de rosca, com volume de escarro de 5 a 10 mℓ.

A amostra de escarro deve ser encaminhada rapidamente ao laboratório de análises clínicas ou armazenada sob refrigeração, em geladeira comum, até seu encaminhamento, preferencialmente no mesmo dia.