Todos que trabalham com microscopia eletrônica devem estar cientes das condições básicas de funcionamento e das diretrizes para manter a segurança dos colegas de trabalho, dos equipamentos e deles próprios. Mesmo que cada laboratório desenvolva os seus próprios conjuntos específicos de regras para uma operação segura, certos princípios e práticas de segurança básica devem ser consideradas em um laboratório de pesquisa. São procedimentos básicos de segurança no laboratório de pesquisa, exceto: